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Test-Performance Studie zur Detektion von Phyllosticta citricarpa, Erreger der Zitrus-Schwarzfleckenkrankheit (CBS)


Laufzeit

2024-04-01 bis 2026-03-31

Projektleitung

  • Clovis, Douanla-Meli


Zuständige Fachinstitut

Institut für nationale und internationale Angelegenheiten der Pflanzengesundheit



Gesamtziel des Projektes

Phyllosticta citricarpa ist ein pilzlicher Pathogen und steht auf A1 EPPO Liste 1 von den nicht in der EU vorkommenden Quarantänen Erregern. Er befällt Zitruspflanzen im subtropischen Regionen, verursacht die Schwarzfleckenkrankheit (CBS) und führt zu einer Verringerung der Fruchtqualität und -quantität. Eine Detektion und Identifikation dieses Pilzes ist zentral für die Früherkennung im Falle eines Ausbruches um eine angemessene Kontrollstrategie zun, aber auch für die Verhinderung der Einschleppung mit importierten Zitrusfrüchten.   Die große Herausforderung der molekularen Identifizierung von P. citricarpa besteht daran, dass diese von anderen Phyllosticta-Arten, wie P. paracitricarpa and P. citriasiana, die auch Zitrus befallen, nicht klar abzugrenzen ist. P. citricarpa und P. citriasiana beispielweise verursachen auf Zitrusfrüchte Symptome die CBS zugeordnet werden (Guarnaccia et al., 2017; EFSA, 2019). In Anbetracht der genetischen Ähnlichkeit zwischen P. citricarpa, P. paracitricarpa, and P. citriasiana und der bedarf einer Früherkennung von CBS wird in dem durch UNICT (IT) und Agdia (FR) durchgeführten BiOrangePack Project ein spezifisches und schnelles Tool für Vorort-Diagnostik erarbeitet. Diese Methode basiert auf Recombinase Polymerase Amplifizierung (RPA) und isothermische Amplifizierungstechnik als Screening-Test nutzbar für Zitrusbauer und Inspektoren. Es existieren bereits weitere Methoden zur Detektion und Identifizierung von P. citricarpa, wie konventionelle PCR und real-time PCR (Ioos et al., 2023). Die Anwendung einiger Methoden ist im EPPO Diagnostik Protokolle PM 7/17(3) empfohlen, aber eine Unterscheidung zwischen P. citricarpa and P. paracitricarpa bedarf immer noch die Sequenzierung von TEF1 Region aus Reinkultur des Erregers. Kürzlich wurde auch ein TEF1-basierte real time PCR für P. citricarpa, die nicht mit nahverwandten Arten kreuzreagiert. Im Rahmen des vorliegenden Euphresco Projektes wird eine kollaborative Test-Performance Studie (TPS) organisiert, um die Robustheit und Reproduzierbarkeit der RPA-basierte Methode in verschiedenen Labore zu verifizieren. Es wird die Fähigkeit zu Detektieren und Identifizieren von P. citricarpa validiert und deren Leistung mit anderen bestehenden molekularen Methoden verglichen.Die geplante TPS soll nach EPPO PM7/122 (2022) Standard organisiert werden.


Mittelgeber

Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft