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WalnussDiv

Molekulargenetische Charakterisierung der genetischen Diversität und Populationsstruktur montenegrinischer Walnussgenotypen


Laufzeit

2026-09-22 bis 2026-12-31

Projektleitung

  • Dragan, Perovic


Zuständige Fachinstitut

Institut für Resistenzforschung und Stresstoleranz


Beteiligte JKI-Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler

  • Dragan, Perovic

Kooperationspartner

  • University of Montenegro Biotechnical Faculty


Gesamtziel des Projektes

Das Vorhaben ist Bestandteil einer Dissertation an der Biotechnischen Fakultät der Universität Montenegro. Ziel ist die morphologische, chemische und genetische Charakterisierung lokaler Walnussgenotypen (Juglans regia L.) aus den nördlichen, zentralen und küstennahen Regionen Montenegros.Im Rahmen eines Forschungsaufenthalts vom 22. September bis 2. Oktober 2026 soll die Doktorandin in der Arbeitsgruppe Molekulare Genetik und Vergleichende Genomik des JKI-RS in Quedlinburg die Isolierung genomischer DNA aus etwa 200 Walnussblattproben erlernen. Die Arbeiten umfassen die Auswahl und Optimierung eines geeigneten Extraktionsprotokolls, die Bestimmung von DNA-Konzentration und -Reinheit, die Überprüfung der DNA-Integrität sowie die Normalisierung und Vorbereitung von 188 geeigneten Proben für eine externe Genotyping-by-Sequencing-Analyse (GBS).Nach Erhalt der Sequenzierungsdaten sollen SNP- und InDel-Varianten identifiziert und gefiltert werden. Darauf aufbauend sind Analysen der genetischen Diversität, Populationsstruktur und Verwandtschaft sowie die Identifizierung genetisch identischer oder nahezu identischer Genotypen vorgesehen. Zusätzlich soll geprüft werden, ob Umfang und Qualität der GBS- und Phänotypdaten eine explorative genomweite Assoziationsanalyse (GWAS) erlauben.


Mittelgeber

Ministry of Science of Montenegro