Der wissenschaftliche Beirat berät die Leitung des JKI bei der Forschungsplanung. Er fördert die Verbindung zu Forschungseinrichtungen im In- und Ausland und unterstützt das JKI in seiner Strukturentwicklung.
Der Beirat besteht aus mindestens sechs, jedoch höchstens fünfzehn Mitgliedern. Die Mitglieder setzen sich aus Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern aus dem In- und Ausland zusammen. Vorraussetzung ist, dass diese zum Zeitpunkt ihrer Berufung noch für einen angemessenen Zeitraum im aktiven Berufsleben stehen. Die Mitglieder werden vom BMEL für die Dauer von vier Jahren bestellt.
Der Beirat wählt aus seinen wissenschaftlichen Mitgliedern die Vorsitzende oder den Vorsitzenden und deren Stellvertreterin oder dessen Stellvertreter. Eine Abberufung durch den Beirat ist möglich.
Carl-Albrecht Bartmer
Deutsche Landwirtschafts-Gesellschaft
Prof. Dr. Bernhard Beßler
Landwirtschaftskammer Niedersachsen
Prof. Dr. Bettina Biskupek-Korell
Hochschule Hannover
Prof. Dr. Carmen Büttner
Humboldt-Universität zu Berlin
Dr. Horst Delb
Forstliche Versuchs- und Forschungsanstalt Baden-Württemberg
Prof. Dr. Dr. Ralf Einspanier
Freie Universität Berlin
Prof. Dr. Dr. h. c. Wolfgang Friedt (Vorsitzender)
Justus-Liebig-Universität Gießen
Dr. Michael Glas (stellvertretender Vorsitzender)
Landwirtschaftliches Technologiezentrum Augustenberg
Prof. Dr. Andreas Graner
Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung
Prof. Dr. Dr. Andreas Hensel
Bundesinstitut für Risikobewertung
Prof. Dr. Bernward Märländer
Institut für Zuckerrübenforschung
Dr. Michael Oberhuber
Versuchszentrum Laimburg
Prof. Dr. Elke Pawelzik
Georg-August-Universität Göttingen
Prof. Dr. Annette Reineke
Hochschule Geisenheim University
Prof. Dr.-Ing. Cornelia Weltzien
Leibniz-Institut für Agrartechnik und Bioökonomie e.V.