Aufgaben und Forschungsgebiete

• Leiter der Arbeitsgruppe “Computer-gestützte Epidemiologie and Pathogenanalyse“ (CEPA)
• Identifikation und Monitoring von Pathogenitäts- und Gesundheitsmarkern pflanzenassoziierter mikrobieller Genome und Metagenome
• Schwerpunkt: Genetische Analyse von pflanzenwachstumsfördernden Eigenschaften und Pathogenitätsfaktoren sowie von hochmolekularen antimikrobiellen Komponenten, wie phagenähnliche Partikel
• Aufbau einer standardisierten und modularen Infrastruktur für die Genomanalyse im Rahmen der nationalen Referenzlabore mit Fokus auf Bakterien, Pilze und Viren
• Anwendung von Phylogenomik, Metagenomik, Transkriptomik, Proteomik, Metabolomik und NGS
• Entwicklung von Software und Webanwendungen

Aktuelle Projekte:

• ABBAonFire
• MOMAPOJA
• Genetische Charakterisierung pflanzenwachstumsfördernder Bakterien aus Halophyten (Cairo University, DAAD)
• PLaBAse: Webressource für pflanzenassoziierte Bakterien und pflanzenwachstumsfördernde Eigenschaften